約翰二世對西方外交政策的核心就是與神聖羅馬帝國皇帝們結盟。這一政策是很有必要的，因爲可以減少南意大利的諾曼人對帝國巴爾幹領土所造成的威脅。在西西里的羅傑二世稱王並在南意大利獲得了至高無上的地位之後，這一威脅變得尤其嚴重了。爲了報答神羅皇帝洛泰爾三世在1136年入侵諾曼人的領地並向南一直推進到巴里，他獲得了拜占庭的回報，其中包括一份巨大的酬金。由於教宗英諾森二世與教會在意大利的領地受到了支持對立教宗Anacletus II的羅傑二世的威脅，所以他也加入了約翰與洛泰爾的聯盟。然而事實上該同盟難以抗衡羅傑二世，羅傑於1139年通過米尼亞諾條約從教皇處獲得了君位。洛泰爾三世的繼任者康拉德三世尋求約翰最小的兒子曼努埃爾能與德國皇室聯姻。最終，康拉德的小姨子Bertha of Sulzbach出嫁到了拜占庭。與此同時，羅傑二世也希望能與約翰二世的兒子聯姻，但他卻沒能成功。
約翰二世傾向於干涉妻子的孃家匈牙利王室，拜占庭帝國把在君士坦丁堡接待流亡的匈牙利王位競爭者視爲擴大帝國影響力的方法和有用的安全策略。然而，匈牙利人卻將這種干涉視爲戰爭的挑釁。匈牙利與塞爾維亞的聯盟給拜占庭在巴爾幹西部的領土造成了嚴重的威脅。
約翰對東線的外交政策與他的父親相似——即挑起科尼亞蘇丹與控制安納托利亞內陸東北部的達尼什曼德王朝之間的矛盾。塞爾柱蘇丹Mas'ud還提供軍隊支援約翰進攻達尼什曼德王朝的城市Kastamuni， 但是和塞爾柱人的聯盟被證明是不可靠的，塞爾柱軍隊放棄了這次出征，趁夜拔營而去。
在黎凡特的十字軍國家普遍承認拜占庭對於安條克的主張是具有法律效果的，但實際上只有當拜占庭皇帝以武力威脅他們的時候他們纔會承認。約翰二世在黎凡特的外交最高峯是1137年他接受了安條克親王 埃德薩伯爵 的黎波里伯爵的效忠。拜占庭帝國渴望被認爲擁有全部十字軍國家的宗主權，其野心在在約翰在通告耶路撒冷王國國王福爾克他將去耶路撒冷武裝朝聖時便可見一斑。
持續不斷的戰爭幾乎佔據了約翰二世的大部分統治時間，而且他不像他的父親一樣熱衷於參與神學研究和教義辯論，他看起來滿足於把宗教事務交給宗主教(牧首)和教會階層去處理。只有當宗教直接影響到了帝國政治，例如有關教宗或希臘拉丁教會聯合的時候約翰纔會參與其中。他還組織了許多希臘與拉丁教會間的神學辯論。
約翰和他的妻子共同參與了宗教與慈善事業，並以他們接手籌建的許多教會建築而聞名，其中包括著名的君士坦丁堡潘托克拉托爾基督修道院(意譯爲全能者基督修道院，今天的澤伊雷克清真寺，約翰二世的皇后在此興建了基督全能者修道院(Christ Pantokrator)，包括基督全能者教堂、圖書館和醫院。皇后去世後，皇帝在第一座教堂之北又修建了仁慈堂(Theotokos Eleousa)，對外開放。1136年增建聖米迦勒小堂連接兩座教堂，作爲科穆寧王朝和巴列奧略王朝的皇家陵墓，約翰二世夫婦、約翰五世等多位皇帝、皇后安葬於此”)。這座修道院由三座教堂組成，它被形容爲中期拜占庭帝國在君士坦丁堡最重要最富影響力的建築之一。一座配有五所病房的醫院隸屬於這座修道院，並向所有社會階層的公衆開放。這座醫院裏有許多不是修道士的專業平信徒醫生在這裏工作。這座修道院還成爲了科穆寧王朝的皇家墓地。
針對保羅派與博格米派異端追隨者激烈的迫害是阿列克修斯一世統治晚期(最後幾年)的特色, 儘管對異端分子的壓制措施仍然生效,但沒有記錄提及到約翰的統治時期有這樣的迫害行動。在君士坦丁堡召開的一次宗教會議中調查了在許多修道院中流傳的一位名叫Constantine Chrysomallos的已故僧侶的作品。基於這些作品中包含了博格米派信條與儀式的元素，他們被君士坦丁堡宗主教Leo Styppes於1140年5月下令焚燬。
皇室家族中的一位成員阿德里安·科穆寧(約翰的叔叔伊薩克~科穆寧的兒子)被他的堂兄約翰二世委以重任。阿德里安成爲了一位僧侶並陪同約翰參加了1138年的戰役。當保加利亞作爲一個自治教區需要一位德高望重的人作爲主教時。阿德里安不久就被任命爲保加利亞大主教。
