亨利恢復教籍保住帝位返回德國後，集中精力整治內部，平息以魯道夫為首的諸侯反對派，曾一度危及他王位的內部反抗勢力逐一告滅。格列高利七世認識到情況有變，於1080年再次對亨利四世處以絕罰(破門律)，開除其教籍。亨利亦再度宣佈廢黜教皇，並任命一名敵對教皇克萊芒三世，隨即率大軍揮戈南下進軍羅馬(1084年)，準備以武力雪洗“卡諾莎之辱”。亨利四世成功地佔領了羅馬，在那裏由偽教皇克萊芒三世加冕為神聖羅馬帝國皇帝。
格列高利七世棄城南逃薩來諾，他向盤踞在西西里的諾曼人首領羅貝爾·吉斯卡爾求援。吉斯卡爾欣然從命。結果諾曼人確實趕走了亨利四世，但他們同時洗劫了羅馬。格列高利七世在孤獨中客死意大利南部的薩萊諾(1085年)。亨利四世很快面對着新的挑戰叛亂，繼任教皇維克托三世聯合帝國諸侯攻打亨利。1105年，亨利四世被推翻並遭到囚禁。後來，亨利逃往列日，並在那裏去世了，新任教皇帕斯卡爾二世下令不得為亨利四世舉行葬禮。
教皇與國王的權力之爭並沒有結束，雙方的繼承者仍然各不相讓，鬥爭又持續了十多年。1122年，在德意志西部的沃爾姆斯城，羅馬教皇和德意志國王共同簽署了《沃爾姆斯協定》：皇帝無權直接任命德意志境內的主教，而是在有皇帝或他的代表出席的情況下，由教士自己選舉產生;主教的政治權力由皇帝授予，宗教權力由教皇授予，神聖羅馬帝國的至尊是羅馬城的教皇，而皇帝淪為二號人物。
卡諾莎之辱將此時歐洲社會政治與宗教力量的不平衡，以及二者之間的矛盾性表現得淋漓盡致。這種情況，直到16世紀英國宗教改革確立“王權至尊”才出現轉機，但它對人民的影響卻是無法迴避的。
