東北是清朝的發祥地，歷來受到清政府的重視。清朝初年，沙皇俄國加緊向外擴張，先後在黑龍江流域建立了雅克薩和尼布楚兩個據點，將它們作爲進一步侵略中國的基地。清政府多次派軍打擊侵略者，但每次中國軍隊得勝回師之後，沙俄匪徒就捲土重來。
爲了徹底解決東北邊境問題，康熙皇帝親自到東北瞭解情況，並決定增加兵力，鎮守黑龍江地方。他還寫信給沙皇，表示願意和平解決兩國爭端。但沙皇遲遲不給答覆，於是康熙皇帝派兵攻克了雅克薩城。沙俄政府見勢不妙，只得同意進行邊界談判。
1689年8月，中俄雙方代表集中到中俄交界處的尼布楚城，展開一場針鋒相對的外交談判。8月22日，中國欽差大臣索額圖和俄國首席代表戈洛文各帶40名隨員和260名衛兵來到談判地點。談判地點設在距雙方駐地各5裏的地方，在那裏搭起兩座緊連在一起的大帳篷。戈洛文提出以黑龍江爲界，河北岸劃歸俄羅斯帝國，南岸屬於中華帝國。索額圖根據史實，說明黑龍江兩岸一直是中國領土，是俄國強行佔領了中國的土地，要求歸還尼布楚和雅克薩等地。雙方各不相讓，談判進入僵局。
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第二天，索額圖根據康熙皇帝的意圖，提出作出讓步，兩國以尼布楚爲界。但戈洛文仍不接受，還在尼布楚哨卡增派300名火槍手，進行武力恫嚇，並以停止談判相挾。其實，沙皇方面早就擬定了三種談判方案：第一方案以黑龍江爲界;第二種方案以尼布楚爲界;如果前兩種方案行不通，則商定日後派代表團再協商解決。因此，戈洛文也擔心談判破裂，無法向沙皇交差。但當中國使團再次作出讓步，提出以格爾必齊河爲界時，戈洛文還企圖索取雅克薩。這時，尼布楚周圍的居民由於不堪忍受沙皇的殘暴統治，紛紛起義，並要求與清朝使團聯合進攻尼布楚。戈洛文發了慌，於是同意中俄邊界以額爾古納河和格爾必齊河爲界，再沿外興安嶺向東直到海邊。河東嶺南歸中國，河西嶺北歸俄國。他們還保證拆毀雅克薩城堡，把軍隊撤離中國領土。
1689年9月7日，中俄雙方舉行隆重的簽字儀式，索額圖和戈洛文先在條約上簽字、蓋章，然後宣讀誓詞，相互交換條約。這個條約就是《尼布楚議界條約》。爲表示慶賀，雙方互贈禮品，還舉行了盛大的宴會。
《尼布楚條約》雖然把原屬於中國的一些土地讓給了俄國，但這是清政府出於戰略上的考慮同意的，是雙方商議的結果。所以說，《尼布楚條約》是個平等的條約。此後150年間，中俄這段邊界一直比較平靜。
