米諾斯王朝充分利用了這一優越的地理位置，發展造船業，並建立了強大的艦隊，這是世界上最早的一支海軍。所向披靡的米諾斯艦隊，使王朝能與埃及、敘利亞、巴比倫、小亞細亞等區域保持貿易來往，併成爲海上霸權國家，愛琴海諸島各國紛紛向米諾斯稱臣，雅典也得向他納貢。無疑，克里特島是歐洲古文明的發祥地之一。但是，大約在西元前1500年前後，克里特島上所有的城市，突然在一夕間全部被毀壞了，這個古老的文明便從地球上永遠地消失了。
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1967年，美國考古學家在克里特島以北130公里的桑託林島的六十米厚的火山灰下，挖出一座古代商業城市。經考證，這座城市是在公元前1500年前後，桑託林火山大爆發時被火山灰所埋葬。那可能是人類歷史上最猛烈的一次火山大爆發，噴出的火山灰渣佔地面積廣達62·5平方公里，島上的城市幾乎在一瞬間就被埋在厚厚的火山灰下，並波及地中海沿岸及島嶼。據記載，當時埃及的上空曾出現三天漆黑一片的情景，除此之外，火山爆發引起巨大海嘯，浪頭高達五十米，滔天巨浪，滾滾南下，摧毀了克里特島上的城市、村莊，米諾斯王國也隨之化爲烏有。
1980年，英國考古學家在克里特島庫諾索斯(Knossos)發掘出一座王宮的廢墟。它佔地約二公頃，房屋有幾百間，均由迂迴曲折的廊道連接，結構之複雜實爲罕見，迷宮中還發現了雙斧標誌，學者一致認爲，這就是米諾斯王國的雙斧宮殿(希臘神話中曾提到雙面斧是克里特島上宮殿的重要特徵)。王宮的牆壁上有豔麗如初的壁畫，倉庫中儲存着大量糧食、橄欖油、酒以及戰車和兵器。一間外包了鉛皮的小屋—有國王無數的寶石、黃金和印章。大量的繪製精美的陶器和做工精巧的金屬器具，表現出克里民特人非凡的才華。
最有價值的是那數萬張刻有文字的泥板，其中一塊赫然寫着：“雅典進貢婦女七人，童子及you女各一名。”出人意料的是，考古學家們真的在克里特島上一所房屋，挖掘出二百多根支離破碎的人骨，是八—十一個年齡不足十—十五歲的青少年，屍骨上並留下被宰殺的刀痕。在希臘神話中也可以找到相關記載。神話中說米諾斯國王爲報雅典王愛琴斯害死其子之仇，用武力強迫雅典人每隔九年必須進貢十四名少年和少女供人頭牛身的怪獸米諾陶食用。最後愛琴斯之子用魔劍殺死了怪物米諾陶。
後來考古學家們挖掘到一座神廟，發現了克里特島人用活人祭祀的證據!現場有許多放置祭品的陶製器皿，供臺上躺了一具身長一六五公分高的青年骨骸，臺邊有一個接血用的盆狀容器，附近還發現了一把宰人的青銅尖刀。而旁邊仰面朝天，手上戴着銀質戒指，雙手捂住臉的骨骸應是祭司與其助手。離祭臺較遠的地方有許多雜亂的屍骨，據推測是參加儀式的官員和祭司的隨從們，來不及跑出廟堂便被砸死了。根據現場情形，考古學家們推測：當克里特島人正在進行活祭，祈求上蒼讓地震災難遠離之時，卻引來山崩地裂，大難臨頭，屋頂猛然坍塌，覆蓋了整個祭祀現場與所有人!
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透過考古學家們的挖掘，我們看到邁諾安文明的發達，卻也看到他的墮落，因爲發現了殺害人命的證據與傳說。我們知道文明的人是能理性思考、和平共處，與尊重生命的。然而在這個時期的文明裏，殺人的行爲卻可以因爲某些理由被容許，而且還由國王與祭司所主導。這是不是說明整體道德的敗壞，對錯不分了?
再進一步想想，一國之君遇到頻繁天災時，不思如何率領全國度過危機，減少百姓的痛苦，卻迷信用活人祭天，祈求消災解難，甚至連監督國事的官員也一同參與，這樣的文明即便能維持表面一定的繁榮，但其實也在不自覺中走向末路了。看看這座毀滅的城市，除了感嘆這麼發達的文明怎麼會消失的同時，我們不妨想想其中的原因：宇宙中萬事萬物確實存在着運行的規律，人類要想文明能長久不衰，順應宇宙的規律，維持善良而正直的心靈力量纔是根本之道。
有證據表明貿易網絡的失敗導致米諾斯的城鎮爲饑荒所毀：米諾斯的麥子供應據信來自於黑海海岸的農場。許多學者相信古代的貿易王朝通常因爲不經濟的貿易而崩塌，因爲缺乏會計手段，食品和糧食通常未被適當地重視，而奢侈品則被不當地過高估價。結果導致饑荒和人口的減小。而同時，日臻成熟的鐵器漸漸取代銅器，米諾斯商人的貿易受到了嚴重的打擊。當饑荒無法爲貿易所緩解的時候，文明的衰落就不可避免了。
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另一個理論指出，米諾斯的航海能力因爲錫拉火山的噴發而遭到重創。這可能間接導致了邁錫尼的入侵，而後者的管理技能無法維持一個貿易王國。錫拉火山的噴發對米諾斯文明的影響仍舊在爭議中。既然錫拉火山的噴發可能是近10000年間最猛烈的一次，考古學家和地質學家質問爲何在根據碳同位素測定出的噴發的時間(根據狐尾鬆測定爲前1628年，根據格陵蘭冰層爲前1645年)和邁諾安文明滅亡的時間(約前1450年)間有如此大的間隔。這個間隔激起了全世界許多學者的興趣，而越來越多的證據和理論被提出，試圖解釋米諾斯文明衰落這個謎團。
這些理論都圍繞着錫拉火山的爆發展開。作爲貿易中心的克里特的穩定與它的航海能力息息相關。這次噴發如今被定級爲VEI-7，如此大的能量足以引發巨大的海嘯，吞噬周圍島嶼的一切港口和船隻，從而給克里特經濟帶來重創。而另一大理論認爲爆發引發的火山灰遮蔽了太陽，導致持續數年的饑荒。而邁錫尼人利用這個時機進攻並征服了克里特島。
