1644年，李自成率軍攻陷北京，崇禎在煤山自縊身亡。當李自成決定將崇禎下葬的時候，竟然發現無地可葬。
明朝的皇帝正常情況下應該埋在天壽山，但天壽山這樣的風水佳地，到崇禎時已經被他的前輩皇帝佔盡了。崇禎曾命大臣在京郊尋找新的墓址，最後找到的墓址竟然是後來清東陵所在的馬蘭峪。然而此時明王朝已經危如累卵，崇禎哪還顧得上這個，因此他活着的時候，一直沒有開始修建自己的陵寢。
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李自成進京後，崇禎和周皇后的屍體被裝進兩口簡陋的棺材，臨時放在東華門的門後面。李自成與太子朱慈烺見面時，朱慈烺請求他安葬父親，李自成應允了，還給崇禎和周皇后各換了一口較好的棺材。
但沒有葬地，如何安葬呢?有人想到，崇禎的禮妃田氏兩年前去世，葬於十三陵，乾脆把崇禎葬在那裏吧。因此，崇禎和周皇后算是搶了田氏的陰宅。
陵址雖有，但崇禎葬得非常寒酸。當時無論大順的重臣還是明朝的降官都有更“重要”的事情要做，所以崇禎的葬禮最後竟落到了昌平州吏目趙一桂身上。更糟糕的是當時戰亂正酣，府庫如洗，根本沒有這筆預算。最終，趙一桂向周圍的鋪戶商人募捐，纔得到233兩銀子。
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明代葬制，帝后妃嬪下葬後要用大石填塞墓道以免盜墓者進入陵寢。趙一桂請了一些人，不分晝夜，用了四天時間纔打開田妃的墓道，以便帝、後棺木進入。可打開、封閉墓道便花掉了200兩銀子，趙一桂用剩下的三十多兩銀子搭蓋薄棚，買紙，買豬、羊、素供，犒賞伕役，伺候送柩員役酒飯等。
這時，監葬官發現，崇禎與周皇后都是有棺無槨，這樣實在不像話，但又沒錢買槨，他靈機一動，將田妃從她的槨中倒出來，僅留內棺，將田妃的槨蓋在了崇禎的棺上。之後，監葬官下令把崇禎放在中間，周皇后放在左邊，田妃放到右邊，然後舉行了祭拜。下葬後，在場人等看到崇禎太過悽慘，不禁落淚，集體現場捐資五兩銀子，給崇禎的陵寢包了一圈磚。
而崇禎的陵墓後來之所以被擴建爲今天的規模，與他在清朝帝王中的“知己”——順治有關。順治爲政前期多爾袞攝政，後期則爲情所困。或許因爲當皇帝也當得不順心，順治來到崇禎的陵上，見到這個倒黴同行的陵墓，慘然不樂，潸然淚下。在順治的推動下，崇禎的陵墓得以整建，從一丘荒冢變得有些帝王陵的氣象了。
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按說，這是件好事，但崇禎未必喜歡，因爲修陵的過程十分堵心。順治下令修繕崇禎陵時，指令三名崇禎宮中舊宦負責。這三人卻藉口資金不足，始終不肯動工。後經崇禎身邊的原司禮監太監曹化淳上奏催促，順治批示“如再延諉，定行重治”，三人才開始工作。修陵缺錢，曹化淳等百般設法，甚至動員降清的文武大員出資捐輸，才籌得數千兩銀子。要知道明清其他皇帝修陵寢，最低也要百萬兩銀子。而這次修陵，最讓人彆扭的是那一套新擺放上來的石五供(石瓶、石祭臺、石香爐等五種祭器)。皇帝墓前的五供有固定的樣式和尺寸，而崇禎這一套祭器偏偏與衆不同。首先，其體量比其他帝陵的五供要大得多;其次，其式樣是給太監用的。
三位明朝舊宦奉命修陵時，他們一定面臨着兩難的抉擇——如果不好好修，別人會在背後指責他們沒良心，這對還要在清廷爲新主子做事的他們來說不是什麼好的評價;而如果好好修，別人又會說他們心懷前朝，一旦有風吹草動很容易被拉出來秋後算賬。
最終，老奸巨猾的他們還真給自己找到了一個解決困境的辦法，那就是把崇禎陵修成了這個樣子—你要說我心懷前朝，那是不對的，你沒有見到我們根本沒按皇帝的規格給崇禎修陵嗎?我們給他放的五供都是和太監一樣的;但你要說我沒良心，也不對，你們沒有看到我們給皇上修的五供個兒都特別大嗎?當然你要說他們首鼠兩端、居心叵測，他們也很容易回答：把陵修成這樣，是我們沒文化，不懂啊，別跟我們這些沒文化的人一般見識。
