1910年2月12日，入藏川軍進駐拉薩，十三世達賴喇嘛在英印當局鼓動下逃往印度。清政府爲了加固邊陲，派遣川軍進駐西藏。1909年6月，川軍入藏，達賴密令藏軍沿途抗阻。6月25日，清政府宣佈達賴罪狀，革去其“阿旺羅布藏吐布丹甲錯濟寨汪曲欲勒朗結達賴喇嘛”的名號，同時令駐藏大臣聯豫依例尋訪靈童，另立新達賴。
十三世達賴喇嘛，即阿旺羅桑土登嘉措鳩差旺覺卻勒南巴甲哇巴桑布，簡稱土登嘉措，1876年5月5日生生於西藏拉薩東南部的達布地區，1879年5月13日坐牀。
十三世達賴喇嘛轉世靈童拉木登珠
1903年(清光緒二十九年)，英國軍隊第二次入侵西藏，次年攻佔春丕、帕裏，直逼江孜，受到藏軍有力的阻擊，這就是西藏曆史上的江孜保衛戰。之後，8月3日英軍佔領拉薩。
十三世達賴喇嘛
十三世達賴在英軍抵達拉薩的前夕，從布達拉宮出走，經黑河，越過唐古拉山，而進入青海，前往外蒙古，意圖經庫倫逃往俄國，被清朝駐外蒙古大臣和從北京欽差大臣勸下。而駐藏大臣有泰藉機向清朝政府“彈劾”十三世達賴“平日跋扈妄爲，臨事潛逃無蹤，請褫革達賴喇嘛的名號。”清朝政府回電：“著即將達賴喇嘛名號暫行革去，並着班禪額爾德尼暫攝。”
後人認爲，十三世達賴是在英軍佔領拉薩時被迫出走，是爲了避免被英軍俘獲。
十三世達賴到達外蒙古以後，即通過清政府庫倫辦事大臣德麟向清政府代表請求援助抗英。清政府“革除”達賴名號引發西藏僧俗的不滿，駐藏大臣有泰也感到不妥，於是向清政府請求“開復達賴名號，以順番情”。
十三世達賴
這時，辛亥革命成功，清帝退位，民國成立。1912年藏曆5月5日，十三世達賴從大吉嶺啓程回藏，曾與九世班禪會晤於熱隆寺，旋又轉到桑頂寺，此時拉薩戰事尚未結束，他在桑頂寺住了兩個月，8月29日離開桑頂寺，12月16日到拉薩。當時，國內政局已發生新的變化，孫中山先生辭去大總統，袁世凱繼之。1912年(民國元年)7月19日，北洋政府設立蒙藏事務局，任命蒙古喀喇沁王爺貢桑諾布爲總裁。十三世達賴主動給貢桑諾布寫信，派蒙古族喇嘛羅布桑東珠爾爲代表，前往北京。
收到十三世達賴來信，袁世凱於民國元年10月28日發出恢復十三世達賴名號的命令：“……現在共和成立，五族一家，前達賴喇嘛誠心內向，從前誤解自應捐釋，應即復封爲誠順贊化西天大善自在佛，以期維持黃教，贊翊民國，同我太平。此令。”
