朱治早年曾擔任縣吏，後被察舉爲孝廉，州里闢其爲從事，隨孫堅到處征戰。中平五年(188年)，拜爲司馬，隨軍討伐長沙、零陵、桂陽等三郡的周朝、蘇馬等賊軍，立有戰功，孫堅表他行都尉。初平二年(191年)，關東聯軍討伐董卓，朱治隨孫堅大破董卓於陽人，進入洛陽，被錶行督軍校尉，特許將領步騎，往徐州幫助陶謙討伐黃巾軍。
從平江東同年，孫堅戰死，朱治便輔助孫策，依靠於袁術。後來知道袁術不立政務、品德，便勸孫策返回江東自立。
朱治太傅馬日磾在壽春，闢朱治爲掾屬，升爲吳郡都尉。當時吳景在丹楊任官，而孫策受命爲袁術攻打廬江，劉繇深怕爲袁術、孫策所吞併，產生誤解、猜疑。但孫策的家人都在州中，於是，朱治派人到曲阿迎接孫策母親及孫權等幼弟，提供養護，對孫家甚有恩惠。興平二年(195年)，朱治從錢唐想進至吳，吳郡太守許貢在由拳抵抗他，兩軍發生戰鬥，大敗許軍。許貢南逃投靠山賊嚴白虎，朱治遂進入吳郡，代領太守事務。孫策成功平定江東。建安二年(197年)，朱治舉孫權爲孝廉。
轉戰江南建安五年(200年)，孫策被許貢門客所傷，不治身亡。朱治與張昭、周瑜等繼續幫助孫權。建安七年(202年)，孫權表朱治爲吳郡太守，行扶義將軍，以割婁、由拳、無錫、毗陵爲食邑，設置長吏。後參與征討夷越，平定東南，擒獲黃巾餘軍陳敗、萬秉等。建安十三年(208年)，曹操佔領荊州，威震南土，孫權之堂兄、曹操的親家孫賁畏懼，欲送兒子到曹軍處爲人質。朱治聽到後，向孫賁陳說安危，孫賁便不送子質。孫權視他爲上將，後孫權爲吳王，朱治每次進見，孫權都會親自迎接，以厚禮待他，設宴、贈予，恩澤、敬意特別多，而朱治的隨從甚至也有禮物。
晚年生涯黃武元年(222年)，朱治被封爲毗陵侯。黃武二年(223年)，拜爲安國將軍，授與金印、紫綬，徙封邑到故鄣。孫權常讚歎朱治憂心、勤於王事，令其擔任督軍御史典屬城文書，不過，朱治只願意接受領四縣的租稅。但當地子弟及吳四大姓家族多到郡出仕，郡吏常常以千計，朱治統轄了數年，全部遣到王府，每次都有數百人。每年進獻，孫權都答報過厚。而當時丹楊深地，叛亂頻頻發生，而朱治仍覺年事而高，思戀故鄉，自表到故鄣屯兵，鎮撫山越。郡中的長老、朋友都到朱治家拜訪，朱治任都引見，與他們共飲歡宴，鄉黨的人都引以爲榮。在故鄣留了數年，返回吳郡，住了三十一年。黃武三年(224年)，朱治逝世，享年六十九歲。據清乾隆《安吉州志》載，墓在順安鄉姚塢(今三官鄉)。
