光化三年(公元900年)十一月，宦官們實現了他們的計劃，將唐昭宗幽禁於少陽院。爲了防止昭宗逃跑，又熔鐵澆在鎖上，每日飯食從牆腳挖的小洞裏送進去。
乾寧五年(公元898年)，朱全忠佔據了東都洛陽，局勢發生了重大變化。導致李茂貞、韓建和李克用建立起暫時的聯盟，他們決定寧可讓唐昭宗回到長安，也不能讓他落到朱全忠手裏。於是，乾寧五年八月，唐昭宗從華州回到長安，同時宣佈改元“光化”。唐昭宗回到長安後，宦官和朝臣之間的舊有矛盾又引發了另一場危機。以中尉劉季述爲首的宦官進行垂死掙扎，策劃廢黜唐昭宗，擁立太子。光化三年(公元900年)十一月，宦官們實現了他們的計劃，將唐昭宗幽禁於少陽院。爲了防止昭宗逃跑，又熔鐵澆在鎖上，每日飯食從牆腳挖的小洞裏送進去。但是，宦官們害怕李克用、李茂貞、韓建等人會興師問罪，想將包袱甩給朱全忠。朱全忠並不是傻瓜，相反，他派人將搞政變的宦官一個個都暗殺了。光化四年，李全忠擁立唐昭宗復位，唐昭宗改元爲天覆。
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在唐昭宗後期，面對朱全忠日益強大的勢力，李克用、李茂貞等藩鎮聯合起來與之對抗，雙方都想挾天子以令諸侯。在宮廷內，唐昭宗希望能夠誅盡宦官。樞密使宦官韓全誨，早有防備，他拉攏李茂貞，挾持唐昭宗逃往李茂貞所在的鳳翔。朱全忠見狀，也率領大軍西進，企圖奪回唐昭宗。朱軍包圍了鳳翔，李茂貞困守其中。鳳翔完全與外界隔絕了一年多，糧食及各種物資越來越缺乏，大雪天寒，凍餓而死的不計其數。唐昭宗雖貴爲天子，但也同樣少衣缺食，他的子女連粥湯都喝不上。唐昭宗萬般無奈，只得出賣自己的御衣以及皇子們的衣服買些豆、麥，“於宮中設小磨，遣宮人自屑豆麥以供御”。圍城中，因飢餓吃人的現象都很普遍了。“人肉每斤值百錢，犬肉值五百錢，每日進奉御膳，就把此肉充當。”直到天覆三年(公元903年)正月，李茂貞實在守不下去了，便將韓全誨等二十多名宦官斬殺，並將他們的首級連同唐昭宗，都交給城外的朱全忠。朱全忠帶着到手的皇帝撤兵東去。
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朱全忠回到長安，命令士兵將幾百名剩下的宦官統統趕到內侍省，並將他們全部殺掉。
困惑中晚唐的宦官問題，終於被朱全忠“解決”了，但唐昭宗卻完全落入了朱全忠的監控之下，苟延殘喘的度過了他生命中的最後時光。大概是爲了“報答”朱全忠，唐昭宗任命朱全忠爲諸道兵馬副元帥，相當於軍隊副總司令。又加封其爲樑王，並賜“迴天再造竭忠守正功臣”的榮譽稱號，還將御筆題《楊柳詞》五首，賜與朱全忠。而此時朱全忠的狼子野心已現，怎會看中是這些呢?
天覆四年正月，朱全忠將唐昭宗遷到重建的東都洛陽並在途中殺害了所有的皇帝侍從。天祐元年(公元904年)八月十一日夜，唐昭宗正在皇宮安歇，朱全忠部將蔣玄暉等帶領一百多人來到皇宮，說有緊急軍情面見皇帝。唐昭宗的一個妃子見來人衆多，正在猶豫，被亂兵揮刀殺死。蔣玄暉等闖入內宮後，見到昭儀李漸榮，問她：“皇帝在哪兒?”昭儀李漸榮大聲說：“寧可殺了我們，你們也不能傷害皇帝!”唐昭宗喝了些酒，正在睡覺，聽到宮外嘈雜，暗覺不妙，急忙起身，只穿着單衣繞柱躲藏，李昭儀用自己的身體護着皇帝，蔣玄暉等便將時年三十七歲的唐昭宗連同李昭儀一起殺害了。
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縱觀唐昭宗的一生，他整頓內政，頗想有一番作爲，但事與願違，王朝事實上早已支離破碎，任何一個手中有一些兵力的藩鎮，幾乎都能隨心所欲地置王朝於死地。唐昭宗所做的，只是勉強使大唐王朝多存在了幾年而已。正所謂，人算不如天算也。
讓國人讚美、懷念了上千年的大唐王朝，終於在內有宦官專權，外有藩鎮割據的擠壓下，至此基本終結，留下的只有千古悲愴，萬代唏噓。
