王重陽得知林朝英在活死人墓中逝世，想起她一生對自己情癡，這番恩情實是非同小可，此時人鬼殊途，心中傷痛實難自已，於是悄悄從密道進墓，避開她的丫鬟弟子，對這位江湖舊侶的遺容熟視良久，仰住聲息痛哭了一場，這才巡視自己昔時所建的這座石墓，見到了林朝英所繪自己背立的畫像，又見到兩間石室頂上她的遺刻。但見玉女心經中所述武功精微奧妙，每一招都是全真武功的剋星，不由得臉如死灰，當即退了出來。
他獨入深山，結了一間茅蘆，一連三年足不出山，精研這玉女心經的破法，雖然小處也有成就，但始終組不成一套包蘊內外、融會貫串的武學。心灰之下，對林朝英的聰明才智更是佩服，甘拜下風，不再鑽研。
後來“九陰真經”出現在江湖中，引起各路武林人士爭奪。王重陽、黃藥師、歐陽鋒、段智興、洪七公決定在華山論劍，誰奪得“天下第一”則歸誰。王重陽武功天下第一，真經終於歸他，其餘四位高手心悅誠服，原無話說。
王重陽因此奪得武學奇書九陰真經。他決意不練經中功夫，但爲好奇心所驅使，禁不住翻閱一遍。
他武功當時已是天下第一，九陰真經中所載的諸般祕奧精義，一經過目，思索上十餘日，即已全盤豁然領悟，當下仰天長笑，回到活死人墓，在全墓最隱祕的地下石室頂上刻下九陰真經的要旨，並一一指出破除玉女心經之法。他看了古墓的情景，料想那幾具空棺將來是林朝英的弟子所用。她們多半是臨終時自行入棺等死，其時自當能得知全真派祖師一生不輸於人。於是在那具本來留作己用的空棺蓋底寫下了十六字，好教林朝英後人於臨終之際，得知全真教創教祖師的武學，實非玉女心經所能剋制。這只是他一念好勝，卻非有意要將九陰真經泄漏於世，料想待得林朝英的弟子見到九陰真經之時，也已奄奄一息，只能將這祕密帶入地下了。
王重陽舊疾復發，爲了在身死之後留下一個剋制西毒歐陽鋒之人。決定帶師弟周伯通到大理來拜訪段智興，只因東邪、西毒、南帝、北丐、中神通五人向來齊名當世，若說前來傳授功夫，未免對段智興不敬，是以先求段智興傳他一陽指，再以先天功作爲交換。
後來王重陽假裝病死，引來歐陽鋒前來搶奪“九陰真經”，王重陽突然從棺材躍出，以一陽指破掉了歐陽鋒的蛤蟆功，使得歐陽鋒退回西域。王重陽也在此之後逝去。
