1、近衛師團
太平洋戰爭爆發後，日軍近衛師團在印度尼西亞掃蕩，並擔任當地的警備。1943年5月14日，近衛師團改稱爲近衛第二師團，美軍實行“蛙跳”戰術，一直沒有進攻印尼，近衛師團只有駐守一直到1945年8月15日日本無條件投降爲止。
2、第一師團
太平洋戰爭後期，戰局急轉直下。日軍第一師團受命被調入萊特島。1944年11月1日，第一師團奇蹟般的在萊特島西岸的奧爾默克地區登陸，準備北上以卡里格拉爲據點進攻塔克羅班地區。但是在東岸登陸的美軍已經完全佔領了塔克羅班地區。1944年11月5日美軍和第一師團在李蒙峽谷遭遇，在之後的50天內，第一師團和美軍互有攻守，呈膠着狀。然而最終第一師團因補給不利，無奈撤向李蒙峽谷的西側的坎奇伯特山區。1944年12月25日，日軍第14方面軍司令官山下奉文大將下達了“自給自足，永久抗戰”的命令。第一師團奉命轉移到色布島上。到1945年1月，第一師團撤離色布島，萊特登陸時有1萬5千名士兵的第一師團此時只剩下800名士兵了。
3、第二師團
太平洋戰爭爆發後，日軍第二師團立即被配屬給今村均中將的第16軍。1942年在日軍攻陷爪哇之後，第二師團被命令在當地執行警備和掃蕩任務。於是，第二師團被捲進了與其命運相關的所羅門羣島的戰役。1942年8月開始的瓜島攻堅戰，纔是第二師團惡夢的開始。爲了奪下瓜島的飛機場，作爲先遣隊，第二師團派出了以步兵第4聯隊爲基幹而組成的青葉支隊(支隊長那須弓雄少將)。爲了與此相配合，川口支隊(支隊長川口清健少將，福岡的第35旅團爲基礎)和青葉支隊一同在瓜島登陸。9月2日，第一次瓜島機場爭奪戰以日軍的失敗而告終。10月初，第二師團主力在瓜島成功登陸，於24日和25日進行了第二次總攻擊。然而得到的又是慘敗，並且以那須少將爲首，步兵第16和29聯隊兩個聯隊長都戰死。雪上加霜的是11月3日，步兵第4聯隊聯隊長又戰死了。這就意味着在瓜島的第二師團失去了他們所有的步兵指揮官。再加上食物和彈藥的補給已經完全被切斷。“瓜”島變成了“餓”島(日語中，“瓜”的發音和“餓”的發音相同)，不斷有士兵餓死和逃走。
4、第三師團
日軍第三師團一直在中國戰場作戰，最後參加了“大陸交通線打通”作戰(“一號”作戰)。中國方面稱之爲豫湘桂戰役。這次戰役分爲第一期“京漢”作戰和第二期“湘桂”作戰，而第三師團參加了“湘桂”作戰。這個作戰的宗旨是：確保從漢口到越南的鐵路沿線，破壞在中國華南地區的盟軍B29轟炸機機場。作戰成功了。最後，第三師團在前往上海的路上，迎來了無條件投降的那一天。
5、第四師團
又稱大阪師團，第四師團在太平洋戰爭初期參加了日軍對菲律賓的進攻，之後曾一度回國整編，1943年第四師團再次被動員，被派往印度尼西亞擔任Sumatra島的警備。最後被派屬給日軍第15軍，進駐在泰國。不久之後在泰國的Lamphum向英國東南亞軍區無條件投降。
