在這場名爲巫蠱的災難中，衛子夫利用皇后的權力，讓太子劉據用中廄車架，從軍械庫中取出武器，並可以調遣長樂宮衛隊。雖然再怎麼說太子是被逼反的，但是事實上確實也真的反了。在封建社會，任何皇帝都不允許謀反。順帶一提，謀反的幫手衛子夫肯定也是漢武帝容不下的。
漢武帝下令沒收了衛子夫的皇后印，但並未下旨廢除她的皇后之位。這是他們夫妻四十多年的最後一次交流。從此衛子夫被漢武帝徹底無視了，這也意味着她絕不可能善終。
其子劉據戰敗後自殺，其璽被收回。衛子夫之後的每一天，都會活在屈辱中，於是這個出身卑微，但是半輩子都極其尊貴的女人選擇了從容自殺，結束了她跌宕起伏的一生。
衛子夫死後，史料中沒有漢武帝處置她屍體的記載。前面說過，她完全被漢武帝忽視了，所以她的身後事辦的極其草率。這個時候，一個熟悉的名字出現在史料中：蘇文。他是漢武帝身邊的黃門，曾經陷害過劉據，也是劉據軍隊要剿滅的主要對象之一。只是這貨油嘴滑舌，見勢不妙，開溜的早，躲過了太子的追捕。
萬萬沒想到，就是這個蘇文，和另一個黃門姚定漢處理了一代賢后衛子夫的屍體。他們把衛子夫的屍體“置之公車令空舍，盛以小棺，將衛皇后葬在長安城南桐柏亭”，沒有皇后該有的盛大葬禮，也沒有金碧輝煌的陪葬品，沒有人來悼念，就這麼早早了事了。
一直到十七年後，衛子夫的曾孫劉詢當上了皇帝。他重新評價了“巫蠱之禍”，賜曾祖母衛子夫“追諡曰思後，置田邑三百家”，諡號“思後”，安排三百戶爲其守墓，重新享受到了皇后應該有的尊榮，她也成爲了中國歷史上第一個有諡號的皇后。
劉詢給她諡號，其實也是讓她和漢武帝徹底分開的意思，橋歸橋，路歸路，過往種種誰對誰錯已經說不清，各自不再見，也不必合葬。
漢武帝，一代天子驕子，一輩子美女無數，死後金銀財寶陪葬品也無數，但是沒有一個人與他合葬，他生前對自己的親人趕盡殺絕，死後也註定只是個孤家寡人。
