自然崇拜在形式上是直接對自然物體進行崇拜，實質上是對各種各樣的自然“鬼神”進行祭拜，以保持其自然宗教的原始特徵。天崇拜。黎族地區不少地方春旱夏澇，人們靠天吃飯。爲了收穫，黎族的先民拜天求雨。他們認爲，雲、霧、雷、風、雨等天體現象都有一種不滅的“靈性”。其中，比較普遍而且認爲最可怕的是雷公鬼、太陽鬼、風鬼等。人頭痛發燒生病時，認爲是因爲觸犯了雷公鬼和太陽鬼;患瘧疾病，是因爲觸犯了風鬼;莊稼遭受蟲害、風災是雷公鬼作祟;打雷閃電要閉目，否則留下痕跡的話那就大病將至了。雷公鬼(天神)威力強大無比。因此，黎族人對天十分敬畏和崇拜。
祭拜儀式多種多樣。每當天鬼發怒，使人肚痛、腰痛、發冷發熱、眼病、腳腫等，要備羊、牛各一頭，由常與天鬼打交道的道公、娘母祭天鬼;下種的前一天，同一宗族的人家請“鬼公”祭天鬼，殺一隻小豬求天鬼保佑;山欄稻苗長到一寸高時，要進行雞卜。殺雞前，先在山欄地旁邊搭一小木架，作爲祭壇，上放五碗飯，五碗酒，五張白色紙錢，一隻小公雞。道公作法事，並念着“天呀，請你下雨吧!”。美孚方言的黎族結婚時，用大豬兩頭置於門口兩旁，飯糰15個，門外放1頭小豬，道公口唸着：“天呀!保佑新郎膝下發財”。若婚後無子，就將男女衣服排放在門口外，念着天鬼，並殺黃牛或豬，求天賜子。合畝制地區的黎族認爲未長牙齒的嬰兒如上身發熱，下身冷、不吃乳、哭而不睡，就叫道公娘母做“天狗鬼”保佑平安。
地崇拜。黎族先人認爲農作物的豐收是“地母”的恩賜，祭祀地母以表示期望和感謝。合畝制地區祭祀“地母(鬼)”盛行。例如在犁田開始時畝頭夫婦先到河裏洗澡更衣，然後回到家裏靜坐，等到太陽西下，畝頭纔去“犁第一道田”，並反覆念道：“大雨降臨如傾盆，點點滴滴落田中”。在播種那天，畝頭獨身到秧地做些象徵性的播種動作，並小心翼翼，以防雞、狗亂叫，見熟人也不吭聲，怕驚動“地鬼”。插秧前，畝頭先插幾株稱爲“谷魂”的秧苗。到谷熟時，畝頭又把數株稻穀捆在一起，中間放着小飯糰，奉給“地鬼”以感謝地鬼的恩賜，婦女到田間捻稻接“谷魂”時，畝頭的妻子念道：“谷魂回來，雞犬避開，安回穀倉”。到吃新稻米時，也要舉行祭祀，全合畝的人都到畝頭家飲酒，唱歌。
水崇拜。“水鬼”在黎族諸神崇拜中居於重要的地位，它主宰田地不受旱澇之災。有水浮神、落水神等。祭祀品有雞蛋、豬頭等。
石崇拜。黎族崇拜石頭，是因爲他們認爲石頭神能促進人的生育，也能防禦莊稼不被鳥獸吃掉。“有石之細潤者，黎人謂之石精，大如棗慄，五色皆有之，黎中珍而藏之以爲寶，謂可鎮家，獵者藏儲身邊，獲禽獸獨多”。“有大如拳者，另爲一種，用水磨之以食犬，則有力而能追逐山獸，可以捷獲。石即考於黎內，幸者無心輒得之，否則尋之不能一遇也。”
山崇拜。過去黎族認爲村中的飛禽走獸都受“山鬼”的統轄，要捕捉獵物，只有得到“山鬼”授意的狩獵首領——“俄巴”同意才能捕捉到。狩獵之前，“俄巴”要進行雞卜和蛋卜，以定吉凶，並用獵物舉行祭祀儀式，把獵物的下齶掛在家裏屋門頂下，俗稱爲“獸魂”。
“山鬼”是黎族人的保護神，人們上山砍山欄園或上山打野豬時，都要先祭山鬼，黎語叫做“開寨”，即開寨門之意。每年正月初二(有的山寨是正月初五)開展祭祀山鬼活動。開寨時，村中的長者在寨門口立住，左手持箭，右手拿青杖。他揮動青杖連呼三聲後打開寨門，然後用青杖象徵性地掃周圍空間，邊掃邊朝山裏走去。在山腳的岔口處早有人備好祭山鬼的酒肉，長者走到那裏就脆下，唱詩歌頌山鬼，祈求山鬼保佑人們進山順利，迴歸平安，搞完儀式後，人們就可以放心進山了。
火崇拜。火在黎族古代社會中佔有極其重要的地位。因爲它能把大片的山欄地焚燒，燒火煮飯，冬天人們又用它禦寒。但是，火又能把森林和村莊燒掉。火成了有靈性的怪物。因此，人們對火由敬畏發展到崇拜，各方言黎族都崇拜火。集中體現在祭祀“竈鬼”的活動中，即任何跨過、敲擊和亂動用三塊石頭砌成的“品”字形的爐竈，都認爲是對“竈鬼”的冒犯，將會受到“竈鬼”的懲罰，使人生病，後果不堪設想。
送“竈鬼”儀式多種多樣，其中，每當農曆十二月二十日這一天，都有類似漢人“送竈公(神)上天”的祀神習俗。原意是說，爲使人間一年四季煙火不斷，竈神能守護竈口，而當除夕將臨近之時，家家戶戶的信民都得爲它備上“快馬”(紙馬)送它進天宮去，向玉帝述職待命。於是，每戶黎家都得請“道公”代畫兩張紙馬，其中拿一張貼於竈壁，另一張祭後燒掉，並供上4個飯糰，1塊豬肉，3杯水酒等祭品，點燒香爐，燃放一串鞭炮，以示送竈神歸天去了。
日、月崇拜。黎族先人對日、月循行一無所知，故崇拜日月。合畝制地區人們正月選擇山欄地，三月初八爲牛節。東方、白沙一帶人們頭痛發熱的時候殺雞來祭祀“太陽鬼”。
風崇拜。昌江、白沙、東方、樂東以及三亞等地的哈方言黎族對“風神”很是迷信。走在路上，突然被“黑旋風”劈頭蓋腦的包抄襲來，十分懼怕。他們認爲，黑旋風是有“來頭”的，是“風鬼”在作怪!因此，無論是大人或小孩碰到“黑旋風”，回到家後都要請“鬼公”查鬼，然後殺小雞祭祀，並將小雞丟到庭院前的牛、豬欄外面。
樹崇拜。昔日黎族村莊周圍都有刺竹密密地包圍，村中間或村門都有一株上百年甚至上千年的大榕樹或者是酸梅樹、芒果樹。樹上晝夜都掛着一個大皮鼓。老人常在樹下向孩子們講述族人的故事。發生械鬥時，頭人就擊響掛在樹上的大皮鼓，召集全村的人向來犯者進行決鬥。久而久之，該樹就成了人們崇拜的神樹，不能隨便用刀砍伐，不能攀登，更不能拴牛，神樹下邊的“鬼臺”即村莊之神，不能亂摸和移動。
鬼魂崇拜。鬼魂觀念是原始人類普遍存在的一種觀念，世界上各個民族的宗教信仰中都有它的遺蹟。前面介紹了黎族先民的自然崇拜，其中就包括對鬼魂的崇拜，如祭“山鬼”、“地鬼”、“竈鬼”、“雷公鬼”、“水鬼”等等，與自然崇拜交叉、融合。另外，在海南島等地的考古發現，證明在新石器時代黎族地區已有巖葬、船棺葬等葬式，從另一方面反映了黎族人民的鬼魂觀念。
