基本思路：陰陽交感而生宇宙萬物，宇宙萬物是陰陽的對立統一。陰陽學說是在氣說的基礎上建立起來的，並在氣說的基礎上，進一步認爲天地，日月，晝夜，晴明，水火，溫涼等運動變化中一分二的結果，這樣就抽象出來"陰"和"陽"兩個相對的概念。陰陽是抽象的概念而不是具體事物，所以"陰陽者，有名無形"(《靈樞·陰陽系日月》)。
陰和陽之間，並不是孤立和靜止不變的，而是存在着相對，依存、消長、轉化的關係。現分述如下：
相對性
陰陽是說明事物的兩種屬性，是代表矛盾對立、統一的兩個方面。是自然界相互聯繫的事物和現象對立雙方的概括。如天爲陽、地爲陰;白天爲陽、黑夜爲陰;上爲陽、下爲陰;熱爲陽、寒爲陰;陽電與陰電等。諸如此類，說明了不論任何事物，都是對立存在宇宙間的，但是，事物的陰陽屬性不是絕對的，而是相對的，必須根據互相比較的條件而定。就人體而言體表爲陽，內臟爲陰;就內臟而言，六腑屬陽，五臟爲陰;就五臟而言，心肺在上屬陽、肝腎在下屬陰;就腎而言，腎所藏之“精”爲陰，腎的“命門之火”屬陽。由此可見，事物的陰陽屬性是相對的。
互根
古代醫學家稱爲“陰陽互根”。中醫學有“陽根於陰，陰根於陽，”，“孤陰不生，獨陽不長”和“無陽則陰無以生，無陰則陽無以化”等論點。意思是說，陽依附於陰，陰依附於陽，在它們之間，存在着相互資生、相互依存的關係――即任何陽的一面或陰的一面，都不能離開另一面而單獨存在。以自然界來說，外爲陽、內爲陰;上爲陽，下爲陰，白天爲陽、黑夜爲陰。如果沒有上、外、白天，也就無法說明下、內、黑夜。以人體生理來說，機能活動屬陽，營養物質(津液、精血等)屬陰。各種營養物質是機能活動的物質基礎，有了足夠的營養物質，機能活動就表現得旺盛。從另一方面來說，營養物質的來源，又是依靠內臟的功能活動而吸取的。
以上說明二者是相互依傍、存亡與共的，如果沒有陰，也就談不上有陽。如果單獨的有陰無陽，或者有陽無陰，則勢必如《內經》所說：“孤陽不生，獨陰不長”，則一切都歸於靜止寂滅了。
消長
指陰陽雙方在對立互根的基礎上是在永恆地運動變化着，不斷出現“陰消陽長”與“陽消陰長”的現象，這是一切事物運動發展和變化的過程。例如：四季氣候變化，從冬至春至夏，由寒逐漸變熱，是一個“陰消陽長”的過程;由夏至秋至冬，由熱逐漸變寒，又是一個“陽消陰長”的過程。由於四季氣候陰陽消長，所以纔有寒熱溫涼的變化。萬物才能生長收藏。如果氣候失去了常度，出現了反常變化，就會產生災害。
臨牀上常常以陰陽偏盛偏衰(即陰陽消長)來說明臨牀的不同證候。例如，寒屬陰、陰盛則見寒證，如受冷後出現的胃寒腹痛、腹瀉等;熱屬陽、陽盛則見熱證，如一般的急性肺炎、有高熱口渴、皮膚紅等急性熱病症狀。有些虛弱的病症，其發病機制不是因爲陰或陽的偏盛，而是因爲偏虛。如果某臟腑的陰偏虛，稱爲“陰虛”，此爲陰消，“陽”相對的突出，因爲熱屬陽，故陰虛見熱證。這種現象稱爲“虛熱”。如果某臟腑的陽偏虛，此爲陽消，稱爲“陽虛”，此時“陰”相對突出，因寒屬陽，故陽虛見寒證，這種現象稱爲“虛寒”。
在正常情況下，陰陽常處於相對平衡的，如果“消長”關係超出一定的限制，不能保持相對的平衡時，便將出現陰陽某一方面的偏盛偏衰，導致疾病的發生。
轉化
指同一體的陰陽，在一定的條件下，當其發展到一定的階段，其雙方可以各自向其相反方面轉化，陰可以轉爲陽，陽可以轉爲陰，稱之爲“陰陽轉化”。
如果說“陰陽消長”是一個量變過程的話，則轉化便是一個質變的過程。《素問》所謂“重陰必陽，重陽必陰”、“寒極生熱”，“熱極生寒”。寒“極”時，便有可能向熱的方向轉化，熱“極”時，便有可能向寒的方向轉化。如某些急性熱病，由於邪熱極重，大量耗傷機體正氣，在持續高熱的情況下，可以突然出現體溫下降，四肢厥冷，脈微欲絕等一派陰寒危象，這種病症變化，即屬由陽轉陰。若搶救及時，處理得當，使正氣恢復，四肢轉溫，色脈轉和，陽氣恢復，爲由陰轉陽，病情好轉。此外，臨牀上常見的各種由實轉虛，由虛轉實、由表入裏、由裏出表等病證變化，也是陰陽轉化的例證。
