正面影響
三百多年前的“湖廣填四川”給四川帶來了不同地域的文化和生活方式，爲四川注入了新鮮的血液，甚至四川無與倫比的感染力和同化力也正是來源於厚重的移民文化，這些外省移民還成爲多數四川人的先祖。
負面影響
然而，“湖廣填四川”對四川的生態環境有着直接的破壞“痕跡”。
資源破壞
西南大學歷史地理研究所所長藍勇長年研究西南地區生態環境狀況，曾對當時情況作出推測：“清初廣大的成都平原和淺丘地區曾是農耕墾殖地區，但灌叢林、茂草和次生林的覆蓋率已經恢復到50%左右，盆地內其他長期的墾殖地區此時也多爲灌叢、茂林覆蓋。順治八年，川耕地不足1.2萬公頃。”陳世鬆也介紹，從戰後到移民高潮來臨前的這一時期，森林植被有了短暫的恢復。“城市鞠爲茂草，村盡變叢林”，就連曾經繁榮一時的成都府也變成了“城中雜樹蓊鬱成林”。清初川北巴山地區主要分佈的是以楠木、松柏爲主的針闊混交林。
而移民入川后，四川的農業墾殖從最初平原荒蕪地的復墾，逐步向丘陵中部、山地推進，墾殖範圍進而到達丘陵頂部、半山上部，當時山田盛行，梯田出現，水土流失嚴重。總耕地面積上百萬公頃，而森林植被則破壞嚴重。
物種消失
專家一致認爲，乾隆元年時期，移民開發把耕地範圍擴張到了山地、丘陵，這是農田墾殖突破傳統範圍的標誌，但同時也是生態環境逐漸萎靡的開始。在森林物種資源方面，一些動物羣落不斷減少，生物數量乃至物種不斷消失。明代川北出沒尋常的華南虎消失就是很好的例證。清初關於虎患的記載有：“直至清初，華南虎在四川分佈廣泛，說明那時墾殖率還比較低，森林相對茂密。”“西鄉縣山深林密，經常有老虎出沒，清溪、桑園鋪等地均有虎食人。”乾隆以來，蜀道沿線各府線仍有虎患，但較清初已經銳減。因此隨着移民的涌入，物種消失的進程顯著加快。
旱災頻繁
研究發現，大移民以來，地質地貌災害、旱澇災害等在四川地區發生得更爲頻繁。16世紀至17世紀是整個明清時期發生乾旱災害最爲頻繁的時期，尤其是17世紀盆地東部地區。陳世鬆等相關專家整合相關的史料時發現，大移民時期是盆地的大旱年份，平均每3年左右就要出現一次。這與《四川歷史旱災表》統計的結論保持了一致：16世紀平均3.3年一次，17世紀平均3年一次，18世紀平均3.7年一次，19世紀平均1.2年一次。
