相關統計
戰後據統計，馬尼拉圍城期間，死亡的菲律賓人總數達10萬人以上，平均每天有3000人遇害。考慮到美軍攻城期間也動用了大量重武器，10萬人中有一部分死於美日兩軍的交火。但大部分菲律賓人肯定是死於日軍有組織的大屠殺。
對日軍評價
從1932年的平頂山慘案到1945年的馬尼拉慘案，日本所謂的“大東亞共榮圈”是以屠殺開始而以屠殺終結。奧斯維辛已經是終極的殘暴，但日本“皇軍”在亞洲的暴行時隔65年仍然在挑戰着所有人承受力的極限。整個近代史上，找不到有哪一支軍隊這樣廣泛的製造和參與對平民的大屠殺。這是一支近代史上最暴虐、最野蠻、最反人類的軍隊，這是一個被宗教狂熱式的天皇崇拜武裝起來的披着文明外衣，卻活在前現代的民族。我們詛咒這支軍隊，我們也同樣警惕產生這樣一支軍隊的民族和文明土壤，因爲屠殺是他們的常態。
1945年2月，捲土重來的麥克阿瑟率美軍直逼馬尼拉城下。日本第14方面軍司令山下奉文大將下令馬尼拉爲不設防城市，但海軍部隊拒絕服從。在美軍強攻馬尼拉期間發生了持續達一個月之久的屠殺事件，直到2月23日，美國軍隊重新奪回馬尼拉。
美軍繳獲了一份這樣的日軍命令：“殺死菲律賓人時，儘量集中在一個地方，採用節省彈藥和人力的方式進行，屍體的處理很麻煩，應把屍體塞進預定燒掉或炸燬的房屋裏，或扔進河裏。”
