東印度公司的破產不是偶然的，其原因有三：
1.公司職員貪污走私成風，使公司總收入銳減。
2.因公司對印度人民的橫徵暴斂，造成印度人民不斷起義。而公司要鎮壓起義，就需大筆開支。這樣就造成了惡性循環，使公司陷於重重危機之中。
3.東印度公司是商業壟斷資本的代表，而工業資本在英國迅速發展壯大，商業資本逐漸失去了它往日的地位。這點，也是公司垮臺的最主要原因。
東印度公司對印度的行政管理成爲英國公務員制度的原型。1813年公司的壟斷地位被打破後公司漸漸脫離了貿易業務。1857年印度民族起義後公司將它的管理事務也交付給了英國政府，印度成爲英國的一個直轄殖民地。1860年代中，公司在印度的所有財產交付政府。公司僅幫助政府從事茶葉貿易(尤其是與聖赫勒拿島)。《東印度公司股息救贖法案》生效後公司於1874年1月1日解散。《泰晤士報》評論說：在人類歷史上它完成了任何一個公司從未肩負過，和在今後的歷史中可能也不會肩負的任務。
在1987年，有咖啡商人成立了一間名爲“東印度公司”的有限公司，並於1990年申請以原東印度公司的紋章作爲自己的商標。但專利局則指“使用這個紋章的公司不能稱呼自己爲‘東印度公司’，但到了1996年，該公司更爲自己成立了網站。該公司現時仍以“東印度公司”的名義售賣聖赫勒拿島的咖啡，並有出版一本介紹東印度公司歷史的書。但是要注意的是，儘管該公司聲稱成立於1600年，但它與原公司在法律上完全沒有關係。
