1793年從科西嘉回來的一等中尉拿破崙，回到了他的炮兵團，駐地在尼斯。他的老首長的兄弟讓·德·泰伊當團長，讓拿破崙當他的副手，讓他負責構築海岸炮臺的防禦工事
就在此時，法國的土倫當時投靠了英國人，而法國將軍卡爾託授命收回土倫，但是卡爾託的炮兵指揮官多馬爾坦剛披掛上陣就受了傷。國民公會的兩名特派員找到了拿破崙並讓他來代替多馬爾坦出任指揮官。拿破崙欣然授命，他從此時來運轉。9月的一天早上，陽光燦爛，他興致勃勃來到土倫港口。
經薩利希蒂推薦，年輕的拿破崙接替了馬爾田少校的職務，擔任土倫平叛部隊的炮兵指揮官。這一任命很快就得到了巴黎軍事當局的批推。誰也沒有料到，正是這樣一個偶然的機遇，使拿破崙獲得了一個初試鋒芒的舞臺。
九月中旬，拿破崙到達了土倫前線，接管了卡爾託部隊整個炮兵的指揮事宜。但他很快發現，這裏的炮兵形同虛設，既無足夠的火炮，又無充足的彈藥，在他到來以前，只有幾門破破爛爛的野炮和臼炮，由一名軍曹一籌莫展地看管着。士兵們沒有起碼的素養，也沒有經過認真的訓練，他們既不會使用火炮，更不懂得如何修理。更可笑的是，他的上司卡爾託將軍，競缺乏炮兵方面的起碼常識，對他那很少的幾門炮，連射程有多遠都一無所知。有作爲的人，即使在惡劣的環境中也能展開非凡的、富有創造性的工作。 爲了改變炮兵的落後狀態，拿破崙不顧旅途的疲勞，立刻投入了緊張的工作。
首先，他想方設法蒐集各種火炮。在不長的時間裏，便弄到近百門大口徑火炮，其中有遠射程的臼炮，有發射二十四磅炮彈的大炮，還有大量的彈藥。接着，他派專人到里昂和格勒諾布爾等地，蒐集一切有用的軍械器材，認並且在奧利烏爾建立了一個有八十名工人的軍械工廠。爲了解決炮兵的機動和工事構築問題，拿破崙徵用了從尼斯到瓦朗斯和蒙彼利埃一帶的馬匹，並在馬賽安排生產了幾萬個供修築炮壘用的柳條筐。
拿破崙不僅是一個出色的組織者，而月是一個腳踏實地的實幹家。 他經常深入士倫前線，和士兵滾在一起，用自己的實際行動和表率作用影響士兵，激勵他們的幹勁和革命精神。不久後，接替卡爾託擔任司令官的多普將軍，後來回憶拿破崙時，寫道：“我發現，他總是堅守在自己的工作崗位上，即使需要休息，也是裹着大氅，睡在地上。他從未離開過炮羣。”就這樣拿破崙的驚人才乾和廢寢忘食精神，很快地在法國士兵中傳開了。他博得了上級的器重和讚賞，不久，被晉升爲炮兵少校。
十月一日，拉波普將軍的部隊開始進攻法朗山地。由於敵人防守嚴密，法朗炮臺的火力非常猛烈，而且地形十分險要，法軍的幾次攻擊均未奏效，被迫停止攻擊，退回原來陣地。
十月十四日，土倫的反革命軍隊出動四千人分成兩路同時出擊，一路向西，一路向西北，企圖重新奪佔馬爾博斯克與奧利烏爾之間的陣地，同時奪取位於勃列加海角的戈拉炮壘和聖克洛特炮壘，改變土倫西面和西北面的防禦態勢(這兩個最近才由拿破崙指揮構築的炮壘直接對小停泊場構成了嚴重威脅)。但由於擔任前衛的那不勒斯軍戰鬥力不強，加上法軍士兵在拿破崙指揮下進行了頑強抵抗，聯軍的企圖沒能得逞，最後不得不停止出擊，撤回土倫。
之後法軍攻佔了小直布羅陀，英國艦隊因此撤退，由於小直布羅陀的失守和英國艦隊的撤退，土倫的防禦開始崩潰。17日下午，聯軍召開軍事會議，決定放棄土倫。當天晚上，聯軍退出了法朗炮臺和馬爾博斯克炮臺，放棄了魯日、勃蘭和聖卡特林多面堡。 18日白天，法軍收復了土倫城外的所有炮臺和陣地，並從東、西兩個方向推進到土倫城下。18日夜間，切爾沃尼上校率領法軍先頭部隊首先衝入土倫。第2天上午，在三色旗的引導下，法軍部隊浩浩蕩蕩地開進土倫。隆重慶祝法軍從外國侵略者手中勝利收復法國南部的重要城市——土倫。收復土倫在政治上產生的影響，遠遠超過了軍事上的意義。它不僅有力地打擊了王黨分子的叛亂活動和反法聯盟的侵略氣焰，而且更重要的是，它向國內外企圖推翻資產階級革命政權的反革命勢力表明，雅各賓專政有着強大威力。 收復土倫之後，法軍在其他戰場上也取得了一系列重大勝利，終於將外國干涉軍從共和國的領土上全部趕了出去。
