柳慶遠成爲蕭衍的霸府謀主後，爲蕭衍做了許多重要的事情。在蕭衍擔任雍州刺史時，柳慶遠作爲雍州別駕從事史，爲他提供了重要的輔助和建議。他不僅在政務上表現出誠懇和忠誠，還展現出卓越的智慧和決策能力。
在南齊內部權力爭鬥激烈的時期，柳慶遠預見到天下將亂的跡象，並認爲蕭衍可能會成爲保護人民、奠定霸業的英雄。因此，他全心全意地投效於蕭衍，並始終盡力輸誠。柳慶遠與其他幕僚一起參與制定起兵攻討蕭寶卷的計劃，並在戰爭中成爲蕭衍西臺軍的謀主。
當蕭衍在永元二年(500年)起兵東征時，柳慶遠始終陪伴在他身邊，負責謀劃軍事行動。他身先士卒，以身作則，展現出傑出的軍事才能和領導力。蕭衍深受他的影響和支持，讚歎柳慶遠嚴謹有序的軍營，並對他深表信任。
建康被攻克後，柳慶遠被任命爲侍中、前軍將軍，並擔任淮陵、齊昌兩郡的太守。柳慶遠的忠誠和才幹使得蕭衍對他賦予了極高的信任和責任。建康城內曾在夜間失火，宮中驚恐不安，蕭衍當時住在宮內，把宮城中所有的鑰匙收起來，問侍從：“柳侍中在哪裏?”等到柳慶遠入宮後，便把所有鑰匙都交給他。柳慶遠就是如此受到蕭衍的信任。
中興二年(502年)二月，蕭衍受封相國、樑公，開建霸府，柳慶遠被闢用爲太尉從事中郎。同年四月，蕭衍受禪即位，即梁武帝。柳慶遠被改授散騎常侍、右衛將軍，加號徵虜將軍，並被封爲重安縣開國侯。其母去世後，柳慶遠辭官服喪，但蕭衍下詔恢復他的原職，柳慶遠固辭不受。
天監二年(503年)正月，柳慶遠轉任中領軍，被改封爲雲杜縣開國侯。
