紅樓夢妙玉結局遭受非議頗多，曹雪芹對妙玉描述是“可憐金玉質，終陷淖泥中”，這樣看來結局一定是悽慘的。還有一種關於紅樓夢妙玉結局是流落到煙花柳巷之中，成爲了一個風塵女子，不過這種說法大多人是不認可的。
一、被迫流落煙花柳巷
由於《紅樓夢》書中所寫妙玉憤世嫉俗，爲社會所不容，只能帶發修道，而內心不正，在“四大家族”衰敗之後，紅樓夢妙玉結局被迫流落煙花巷，當起娼妓，又爲世俗所不容。結果是“欲潔何曾潔，雲空未必空。可憐金玉質，終陷淖泥中”，而《紅樓夢》中“世難容”詞曲爲妙玉最後流落煙花巷寫下最大伏筆。在紅樓夢人物關係圖中妙玉也是位列金陵十二釵之一。
二、被強盜輕薄自殺
在高鶚的續本第一~二回“活冤孽妙尼遭大劫，死讎仇趙妾赴冥曹”中，紅樓夢妙玉結局被內賊何三引入的賊人使迷香悶住擄走。得知妙玉被抓後，惜春心想“但是他素來孤潔的很，豈肯惜命?”而第一~三回中，寶玉也說“這個人必不肯受，一定不屈而死”。可見高鶚爲她安排的結局是爲強人所擄，不堪淫辱輕薄，自尋了斷的。
三、被老富翁買去做妾
有一條脂批說：“瓜洲渡口……紅顏固不能不屈從枯骨”。推測起來紅樓夢妙玉結局，她可能在榮府敗落後流落到瓜洲，被某個老朽不堪的富翁(枯骨)買去作妾，這是多慘的悲劇。這應該是“終陷淖泥中”的含義，與高鶚續書寫的被強盜掠去有別。
四、妙玉和忠順王同歸於盡
賈府此時已然頹敗，成爲政治鬥爭的犧牲品。賈母殯天，賈政絞斃，黛玉沉湖，寶釵化蝶，鳳姐投河，湘雲被賣。而寶玉因當年寫下的《嬀嫿將軍詞》而獲罪，忠順王通緝寶玉卻因其容貌相仿而捉到了甄寶玉。賈寶玉聽說此事，自首換出了甄寶玉。就在此時，妙玉違背師傅“不宜還鄉”的遺命，來解救賈寶玉。
她帶了幾箱名瓷古玩——包括四十一回櫳翠庵品茶中的幾樣茶具，在瓜州渡口遇見了被賣入“花船”做樂妓的史湘雲，並將她贖出。而後去求見忠順王，要求用家傳的幾箱名瓷古玩交換賈寶玉。然而貪婪的忠順王見美色起淫心，要妙玉連人帶物一起作交換條件，妙玉竟然應允。
只是要求忠順王當面放走寶玉，並要求寶玉和湘雲一起遠遁，不許派人追趕。妙玉終於看到寶玉湘雲遇合離去。忠順王要抱妙玉上牀求歡，妙玉卻說要先賞玩珍寶，忠順王答應了。當他貼近觀看時，妙玉拉動了箱外的機關，箱中有消息兒炸藥，妙玉和忠順王同歸於盡。
