荷爾拜因在創作一幅肖像畫以前，經常用鉛筆描繪衣物、裝飾品等細節，有時也用鋼筆或堊筆，然後在紙上沿輪廓紮上小孔，鋪在畫布上，用炭粉將其轉移到畫布上。在晚年也使用複寫紙。他的畫作對細節描繪非常詳細、真實，甚至於儀器上的刻度、信箋上的文字、桌布上的花紋都描繪的一絲不苟，但整體風格仍然非常統一，人文主義風格非常明顯，俄羅斯作家陀斯妥耶夫斯基曾經評價他的作品《墓中的基督》：“可以把許多人的信仰奪去。” 他曾經從同爲英國王室畫家的弗拉芒畫家盧卡斯·霍亨布特那裏學習畫微型畫，盧卡斯曾爲他畫了一幅微型畫像，他自己從沒有畫過自畫像。
在寫實方面，荷爾拜因的後期作品《吉斯策像》、 《大使像》和《莫萊特像》等，更是精益求精，達到了前所未有的高度，畫中的人物與環境的描繪都精細無比，可置於放大鏡中審視，而整體上又不失其明快、秀逸的風格。 荷爾拜因的作品《金銀匠摩賴特像》在很長時間內被認爲是達·芬奇的作品。他簡潔的素描頭像，在美術史上獨樹一幟，他的用線是在竭力模仿對象，完全排斥了自我想象和情感。
荷爾拜因宗教畫的傑作有《索洛圖恩的聖母》和《達姆施塔特的聖母》，它們都以所藏城市命名。兩幅畫都吸收了意大利藝術的影響，構圖均衡和諧，聖母形象着重樸實平凡的神態，在文藝復興的聖母像中獨具一格。荷爾拜因還是傑出的版畫藝術家，他最成功的版畫作品是組畫《死神之舞》，共41幅。死神威脅一切階層的故事反映了羣衆中流行的宗教思想，有憤世嫉俗之意，木刻線條流暢簡約，風格灑脫，在內容和形式上都非常受羣衆歡迎。
