1887年3月，普朗克與一個慕尼黑中學同學的妹妹瑪麗·梅爾克(Marie Merck，1861年-1909年)結婚，婚後生活在基爾，共有4個孩子卡爾(Karl，1888年-1916年)、雙胞胎埃瑪(Emma，1889年-1919年)和格雷特(Grete，1889年-1917年)以及埃爾溫(Erwin，1893年-1945年)。在普朗克前往柏林工作後，全家住在柏林的一棟別墅中，與不計其數的柏林大學教授們爲鄰，普朗克的莊園發展成爲了一個社交和音樂中心，許多知名的科學家如阿爾伯特·愛因斯坦、奧托·哈恩和莉澤·邁特納等都是普朗克家的常客，這種在家中演奏音樂的傳統來自於亥姆霍茲家。在度過了多年幸福的生活後，普朗克遇到了接踵而至的不幸。
1909年10月17日普朗克的妻子因結核病去世。
1911年3月普朗克與他的第二任妻子瑪格麗特·馮·赫斯林(Margaret von He SiLin，1882年-1948年)結婚，12月普朗克的第三個兒子赫爾曼(Herrmann)降生。
第一次世界大戰期間，普朗克的大兒子卡爾死於凡爾登戰役，二兒子埃爾溫在1914年被法軍俘虜，1917年女兒格雷特在產下第一個孩子時去世，她的丈夫娶了普朗克的另一個女兒埃瑪，不幸的是埃瑪在兩年後同樣死於生產。普朗克平靜地經受了這些打擊，格雷特和埃瑪的孩子存活了下來，並且繼承了她們各自母親的名字，普朗克也爲她們取名格雷特和埃瑪。1945年1月23日，普朗克的二兒子埃爾溫·普朗克因參與暗殺希特勒未遂而被納粹殺害，至此，普朗克與其第一任妻子所生的4個孩子全都去世。
普朗克本人是一個不情願的革命者。其成就的深遠影響在經過多年以後纔得到普遍公認，愛因斯坦對此起了最爲重要的作用。自20世紀20年代以來，普朗克成爲德國科學界的中心人物。他的公正、正直和學識，使他在德國受到普遍尊敬，具有決定性的權威。納粹政權統治下，他反對種族滅絕政策，並堅持留在德國盡力保護各國科學家和德國的物理學家。爲此，他承受了巨大的家庭悲劇和痛苦。他憑藉堅忍的自制力一直活到89歲。
獲得大學任教資格後，普朗克在慕尼黑並沒有得到專業界的重視，但他繼續他在熱理論領域的工作，提出了熱動力學公式，卻沒有發覺這一公式在此前已由約西亞·威拉德·吉布斯提出過。魯道夫·克勞修斯所提出的“熵”的概念在普朗克的工作中處於中心位置。
1885年4月，基爾大學聘請普朗克擔任理論物理學教授，年薪約2000馬克，普朗克繼續他對熵及其應用的研究，主要解決物理化學方面的問題，爲阿累尼烏斯的電解質電離理論提供了熱力學解釋，但卻是矛盾的。在基爾這段時間，普朗克已經開始了對原子假說的深入研究。
1897年，哥廷根大學哲學系授獎給普朗克的專著《能量守恆原理》(Das Prinzip der Erhaltung der Energie，1897年)。
1889年4月，亥姆霍茲通知普朗克前往柏林，接手基爾霍夫的工作，1892年接手教職，年薪約6200馬克。
1894年，普朗克被選爲普魯士科學院(Preu?ische Akademie der Wissenschaften)的院士。
1907年維也納曾邀請普朗克前去接替路德維希·玻耳茲曼的教職，但他沒有接受，而是留在了柏林，受到了柏林大學學生會的火炬遊行隊伍的感謝。
1926年10月1日普朗克退休，他的繼任者是薛定諤。
