徐福是秦始皇時代的著名方士，在爲始皇尋找長生不老藥時一去不歸，而徐福東渡也成爲了一個千古謎團。很多人都對徐福東渡的去向進行了猜想，有一種說法是徐福去了日本。
根據考古研究，徐福東渡的時候日本剛好從繩文時代過渡到彌生時代。所謂繩文時代，就是日本的新石器時代，由於在陶器上裝飾有繩文而得名。彌生時代是日本的青銅器時代，當日本社會進入了以農耕、畜牧爲主的經濟階段，出現了青銅器、鐵器。
在日本彌生時代文化遺址裏，曾發現大量青銅器，有銅劍、銅矛、銅戈，以九州地區最多。這些出土的青銅器與中國山東地區出土的青銅器類似。爲此，有些日本學者推斷，在日本彌生時代曾有大量秦漢時代的中國人東渡到了日本，而他們首先到達的就是日本九州島。
(彌生人和繩文人在面相上的區別)
一些日本學者確信徐福東渡促成了日本彌生時代的出現。事實上，日本學者認爲由繩文文化向彌生文化的過渡是一次質的飛躍，其轉變是突發性的，而這種轉變很可能來自一種外來文化的影響。他們認爲，是徐福帶來了中國古代文明，稻穀因此傳入日本，結束了日本人的漁獵生活，開始了農耕、種植。徐福也把絲綢、醫藥帶到了日本。在日本民間，徐福被尊稱爲農神、醫藥神，這也成爲日本學者猜想的依據。
在日本有一個吉野裏遺址，考古學家表明，它是日本彌生中期遺址。在這裏發現了“吉野裏環壕集落”，建築材料來源於古代中國，形狀也和中國的王城很像。這是一座體現古代中國城市構造的城堡遺蹟，發掘中還發現了大量青銅器、鐵質武器、鐵質工具和製造青銅器的工具。
考古學家還表示，遺址中有幹欄式建築 ,這種建築與戰國末期的江南有關,也間接說明說明彌生時代可能與吳越人有關。日本學者研究表明這些可能都是秦漢時代的器物，吉野裏有140公頃的遺蹟得以復原，其中有一百多棟建築，對徐福東渡的依據有所體現。
實際上，不止是那些日本學者，很多日本民衆也相信徐福到達了日本，日本人肯定了徐福對中日文化交流的貢獻，關注對徐福東渡的研究，期望徐福東渡之謎的破解。在日本的一些非正式的史書中，記載了徐福是如何來到日本的，以及徐福的血脈是如何在日本延續下去的。據統計，日本各地跟徐福有關的遺址有50多處，疑似的登陸點有20餘處，傳說故事也有30多個。
這些遺址和傳說並不一定是真的，但卻讓很多日本人對徐福東渡日本有了肯定的態度。事實上，徐福東渡的去向至今也沒有定論，日本學者的話也只是從可能性方面給人們提供了一個猜想的方向。
