所著醫書有《傷寒發微》、《金匱發微》、《經方實驗錄》、《曹穎甫醫案》等，理論透徹周詳而又切實用。
《傷寒發微》
《傷寒發微》是曹穎甫先生40餘年對《傷寒雜病論》探索的心得，論述密切臨牀，精湛允當。曹氏註釋《傷寒論》一洗空泛之浮論，專務實學，考據精詳，凡無字之處必反覆探討，一再解釋。而仲景之不出方治者，綜而覈對，甚爲周密，提出方治，以啓示後來。曹氏注重臨牀實踐，常借臨牀驗案闡發病症變化機理，並以此進一步驗證仲景經方的臨牀實用價值，對理論與臨牀的結合，起了很好的示範作用。
《金匱發微》
《金匱發微》是曹穎甫先生40餘年對《傷寒雜病論》探索的心得，論述密切臨牀，精湛允當。曹氏《金匱發微》最大特色，就是書中附錄大量個人治驗，突顯其“考驗實用”，能於諸家註釋之外獨樹一幟。曹氏注重臨牀實踐，常借臨牀驗案闡發病症變化機理，並以此進一步驗證仲景經方的臨牀實用價值，對理論與臨牀的結合，起了很好的示範作用。
《經方實驗錄》
《經方實驗錄》是曹氏長期臨牀效驗的縮影和精華薈萃。曹氏一生治醫專宗仲景，善用經方而聞名。其間用經方取效者十常八九。《經方實驗錄》分上中下3卷，共計92案。其中大多醫案有一劑知，二劑已，甚則覆杯而愈的效果。
